शाह ने एक मनोरंजन वेबसाइट को दिए साक्षात्कार के दौरान भारत और पाकिस्तान के बीच दुश्मनी पर खेद व्यक्त किया था और कहा था कि भारतीयों के दिमाग में यह भरा जा रहा है कि पाकिस्तान उनका दुश्मन है। नसीर ने यह भी कहा था कि जब भारतीय कलाकार पाकिस्तान जाते हैं तो उनका बाहें फैलाकर स्वागत होता है मगर भारत में पाकिस्तानी कलाकारों को विरोध झेलना पड़ता है। उन्होंने कहा था कि वह पाकिस्तान जाते रहते हैं क्योंकि उन्हें लगता है कि वहां के लोगों से संपर्क होना बहुत महत्वपूर्ण है।
शिवसेना ने अपने मुखपत्र सामना में लिखा, नसीरूद्दीन शाह ने पूछा है कि पाकिस्तान के लिए इतनी नफरत क्यों है। उनके इस प्रश्न का जवाब वे लोग दे सकते हैं जिन्होंने मुंबई में हुए आतंकी हमलों में अपने प्रियजनों को खोया है। पाकिस्तान रक्तपात में शामिल है। केवल मुंबई हमले ही नहीं, दिल्ली में संसद पर हमला और इससे पहले भी हुए आतंकवादी हमलों की साजिश पाकिस्तान में रची गई। शिवसेना ने नसीर की आलोचना करते हुए कहा कि अभिनेता ने इतने वर्षों की कड़ी मेहनत से जो नाम कमाया है, वह गंवा दिया है । शिवसेना ने कहा, केवल दो ही दिन पहले कश्मीर की कठुआ पुलिस चौकी पर आतंकी हमला हुआ था जिसमें एक भारतीय जवान शहीद हो गया। उस जवान के माता-पिता से जाकर पूछो कि उनके दिल में पाकिस्तान के लिए इतनी नफरत क्यों है।